مقایسه خاموش کننده های فلورسنت و غیرفلورسنت روش real-time pcrدر پلات های آمپلیفیکیشن استاندارد ژن دلتا-۶ دساتوراز در کشت سلولی رده panc-۱
نویسندگان
چکیده
زمینه: استفاده از خاموشکنندههای غیرفلورسنت در روش real-time pcr برای بررسی بیان ژن مناسب است. هدف: مطالعه به منظور مقایسه توانایی دو نوع خاموش کننده فلورسنت و غیرفلورسنت با توجه به نتایج real-time pcr انجام شد. مواد و روشها: این مطالعه تحلیلی در سال 1391 در آزمایشگاه رفرانس دانشگاه علوم پزشکی قزوین انجام شد. سلولهای سرطانی پانکراس انسان ( (panc-1 در فلاسکهای 75 سانتیمتری کشت و تکثیر شدند. سپس 106×3 سلول در پلیتهای 6 خانهای تحت تأثیر داروهای مؤثر بر سیگنالهای خاص درون سلولی قرار گرفتند و میزان تغییر بیان ژن دلتا-6 دساتوراز در شرایط یکسان، یک بار با خاموشکننده فلورسنت و بار دیگر با خاموشکننده غیرفلورسنت با روش real-time pcr بررسی شد. دادهها با آزمون آماری تی و براساس روش δδct با فرض کارآیی 100 درصد تحلیل شدند. یافتهها: خاموش کنندههای فوق، با جذب متفاوت نشر گزارشگر (reporter) ، باعث تفاوت در نتایج حاصل از real-time pcr شدند. پلات آمپلیفیکیشن هنگام استفاده از خاموشکننده غیرفلورسنت، دقیقتر و میزان خط پایه ( base line ) پایینتر بود و به این ترتیب نسبت سیگنال به noise کاهش یافت. با استفاده از خاموشکننده غیرفلورسنت، به دلیل افزایش دمای ذوب (tm) و کاهش اتصالات غیراختصاصی، میزان عددی دوره آستانه ( ct ) نیز کاهش یافت. نتیجهگیری: با توجه به یافتهها، استفاده از خاموشکننده غیرفلورسنت نسبت به فلورسنت مناسبتر و جایگزین بهتری برای خاموش کنندههای متداول، به خصوص در مطالعههای تشخیصی آللها و snp (single nucleotide polymorphism) بود .
منابع مشابه
مقایسه خاموش کننده های فلورسنت و غیرفلورسنت روش Real-time PCRدر پلات های آمپلیفیکیشن استاندارد ژن دلتا-6 دساتوراز در کشت سلولی رده PANC-1
زمینه: استفاده از خاموشکنندههای غیرفلورسنت در روش Real-time PCR برای بررسی بیان ژن مناسب است. هدف: مطالعه به منظور مقایسه توانایی دو نوع خاموش کننده فلورسنت و غیرفلورسنت با توجه به نتایج Real-time PCR انجام شد. مواد و روشها: این مطالعه تحلیلی در سال 1391 در آزمایشگاه رفرانس دانشگاه علوم پزشکی قزوین انجام شد. سلولهای سرطانی پانکراس انسان ( (PANC-1 در فلاسکهای 75 سانتیمتری کشت و تکثیر...
متن کاملبررسی اثرات عصاره هیدروالکلی جلبک Sargassum ciliforium بر رده سلولی سرطان کولون HT-29 و ارزیابی بیان ژن های P53 و APCبا روش Real time PCR
سرطان روده بزرگ سومین سرطان شایع در جهان است. با توجه به افزایش بروز سرطان استفاده از مولکول های جدید شیمی درمانی مورد نیاز می باشد. بسیاری از مطالعات و تحقیقات نشان داده است که سرطان روده می تواند از طریق محصولات دریایی طبیعی که دارای مقادیر بسیاری از مواد فعال بیولوژیکی با ساختارهای شیمیایی و فعالیت های دارویی جدید هستند درمان شود. هدف از این مطالعه بررسی اثرات عصاره هیدروالکلی جلبک Sargassum...
متن کاملبررسی بیان ژن های CCDC26 و C-Kit در رده های سلولی لوسمی لنفوبلاستیک حاد
Background and Aim: Acute Lymphoblastic Leukemia is the most common cancer in children and is one of the main causes of their mortality. In this study, we examined the expression of long noncoding RNA CCDC26 gene and its downstream C-Kit gene in acute lymphocytic Leukemia cell line. Materials and Methods: This is an experimental study. In this study, the acute Lymphoblastic Leukemia cell lines...
متن کاملبررسی سمیت سلولی نانوذره اکسید سریم (CeO2) روی رده سلولی سرطان کولون ( HT29 )و آنالیز بیان ژن های آپوپتوزی کاسپاز 3 و 9 با استفاده از روش Real Time PCR و فلوسیتومتری
هدف: هدف از مطالعه حاضر بررسی اثرات سمیت سلولی نانو ذره اکسید سریم روی رده سلولی سرطانی کلون HT29 و آنالیز بیان ژنهای آپوپتوزیسی کاسپاز 3 و 9 میباشد. مواد و روشها: در این مطالعه سلولهای HT 29 در فواصل زمانی 24، 48 و 72 ساعت تحت تاثیر غلظت‌های 78/0، 56/1، 12/3، 25/6، 5/12، 25،50، 100 میلیگرم بر میلیلیتر از نانوذره اکسید سریم قرار گرفته و...
متن کاملشناسایی لیستریا مونوسیتوژنز از شیر خام به روش های کشت سلولی و PCR ژن actA
مواد غذایی از راه های مختلفی در معرض آلودگی میکروبی قرار می گیرد. یکی از باکتری های بیماری زا که از طریق مواد غذایی از جمله: شیر خام، سبزیجات به انسان منتقل می شود، باکتری لیستریا مونوسایتوژنز است که باعث بیماری های مختلفی از جمله: مننژیت، کنژونکتیویت، سپتی سمی و سقط جنین می باشد. با توجه به گزارشاتی که از آلودگی های شیر و فرآورده های آن به لیستریا مونوسایتوژنز داریم، به خصوص در کشورهای در حال ...
متن کاملمقایسه الگوی بیانی ژن های اصلی مسیر خود بازآفرینی در رده های سلول سرطانی، بافت سرطانی و بافت سالم تومور مثانه
زمینه و هدف: یکی از دلایل ایجاد سرطان، بیان نا به جای ژن های کنترل کننده مسیر خود بازآفرینی در سلول سرطانی است، لذا در این مطالعه بیان ژن های اصلی کنترل کننده مسیر خود بازآفرینی شامل OCT4، NANOG، KLF4، SOX2 و Nucleostemin در دو رده سلولی 5637 و HT1376، بافت سرطانی و بافت سالم نمونه های بیوپسی بافت سرطانی مثانه، مورد بررسی قرار گرفت. روش بررسی: در این مطالعه آزمایشگاهی، رده های سلولی در فلاسک ها...
متن کاملمنابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
عنوان ژورنال:
مجله علمی دانشگاه علوم پزشکی قزوینجلد ۱۷، شماره ۵، صفحات ۱۷-۲۴
کلمات کلیدی
میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com
copyright © 2015-2023